В конце XIX века в районе старинного села Ковда, богатом хорошим строевым лесом, и имеющим глубокое и защищенное от ветров морское побережье, стала интенсивно развиваться лесопильная промышленность. В трех верстах от села, на острове Березовый, был построен лесозавод и оборудован порт, для бесперебойной работы которого требовалось знание погодных условий.
15 апреля 1896 года для освещения района в гидрометеорологическом и синоптическом отношениях на о. Березовый Главной геофизической обсерваторией была организована гидрометстанция.
До 1905 г. наблюдения на станции производились регулярно с небольшими перерывами, затем на 7 лет были прекращены. В сентябре 1912 г. усилиями Гидрометеорологической службы Отдела торговых портов Министерства торговли и промышленности наблюдения были возобновлены и проводятся по настоящее время.
За период своего существования станция несколько раз переносилась, наиболее значительный перенос с острова Березовый в село Ковда осуществлен в октябре 1929 года. Числясь первоначально как поселковая, в 1987 г. в связи с резким сокращением лесопроизводства, рыбного промысла и массовым отъездом местных жителей из ставшего бесперспективным села, гидрометеорологическая станция Ковда переведена в разряд труднодоступных (ТДС).
ТДС Ковда – крайняя южная метеостанция в Мурманской области. Данные ее наблюдений хорошо отражают синоптическую ситуацию при выходе южных циклонов. Расположение станции на границе моря и суши позволяет регистрировать метеоэлементы, которые в теплый период года ярко иллюстрируют морской климат, а в холодный период при устойчивом замерзании Кандалакшского залива – континентальный.
Помимо метеонаблюдений выполняются морские прибрежные и ледовые наблюдения в Губе Ковда и Кандалакшском заливе. Полученные данные участвуют в оперативном обмене и пополняют Единый государственный фонд данных о состоянии окружающей среды, ее загрязнении.